No filme, Ash continua sua jornada pelas Ilhas Laranja junto com Misty e Tracey até que uma tempestade estranha e inesperada leva o barco deles para fora da rota em uma ilha que no momento comemora um antigo festival regido por uma lenda, que diz que ao pegar os três tesouros, o escolhido salvará o mundo e domará a fera do mar. Devido a suas característica, Ash acaba se tornando o escolhido e sai em busca dos tais tesouros.
Na sua busca, ele acaba sendo capturado junto com Moltres (o pássaro lendário do fogo) e Zapdos (o pássaro lendário do trovão) por um estranho colecionador que deseja ir mais além capturando Articuno (o pássaro lendário do gelo) para com as três aves lendárias despertar a fera do mar: Lugia! O problema nisso tudo é que, com a harmonia das três aves desfeita, o mundo começa a entrar em colapso e cabe a Ash agora cumprir seu papel como escolhido e salvar o mundo mais uma vez.
